甘肃农业大学从1953年开始招收和培养研究生，是我国高校中首批硕士学位授予单位，第二批博士学位授予单位，第二批开展在职人员以研究生毕业同等学力申请硕士学位工作单位，首批培养农业推广硕士和兽医硕士专业学位研究生的单位。现有作物学、畜牧学、兽医学3个一级学科博士学位授权点,19个博士学位授权点；农业工程、园艺学、农业资源利用、植物保护4个一级学科硕士学位授权点，43个硕士学位授权点；有兽医博士学位授权；有农业推广（作物、植物保护、园艺、农业资源利用、养殖业、草业、林业、农业机械化、农村与区域发展、农业科技组织与服务、食品加工与安全）和兽医2种硕士专业学位授权；学位授权涉及理、工、农、经、管、医多学科.草业科学为国家级重点学科,畜牧学、兽医学、作物学为博士后科研工作流动站设站学科，动物遗传育种与繁殖为农业部重点学科,草业科学、作物学、动物遗传育种与繁殖、兽医学、动物营养学与生产学、生态学、植物保护、园艺学、林学、食品科学与工程、农业工程、农业经济管理等12个学科为甘肃省重点学科。现有博士研究生导师87人，硕士研究生导师402人,有丰富的办学经验和雄厚的师资力量.建校60多年来,甘肃农业大学已为西北地区及全国培养了数百名硕士、博士，为国家经济和社会发展做出了重要贡献。目前在校各类研究生人数达2000余名。
     一九九九年十一月，甘肃农业大学研究生处被教育部、国务院学位委员会授予
“全国学位与研究生教育管理工作先进集体”称号。